Transcript
Ablaufplan Vorlesung und Praktikum Genetik 2 Stand: 13.10.15 Woche 1 (30.11.-04.12.15) Montag
Dienstag
Mittwoch
Donnerstag
Freitag
Vorbesprechung Versuch 2 (Ziebart) 9:00-10:00
10:00-11:00
Parasitismus: Trypanosoma als Modell (Zellkultur, Tet-System, GFP, Fluoreszenzmikroskopie, Durchflusszytometrie) (Boshart)
Regulation der Transkription (Parniske)
Vorbesprechung Versuche 1, 3 und 4 (Brachmann)
Gene Silencing (Parniske)
Versuch 1.1: Auswertung der Transformationsplatten Versuch 3.1: Ansetzen von Ü/N-Kulturen
11:00-12:00
"Deciphering the function of trypanosome epigenome in gene regulation and immune evasion" (Nicolai Siegel, Uni Würzburg)
Vorbesprechung Versuch 2 (Ziebart)
Allgemeine Kurseinführung und Sicherheitsbelehrung (Brachmann)
Versuch 4.1: Hefetransformation
Vorbesprechung Versuch 1, DNA-Isolierung (Brachmann)
12:00-13:00
Vorbesprechung Versuch 1 (Brachmann) 13:00-14:00
Versuch 4.1: Ausplattieren der Hefetransformanten
Versuch 3.1: Verdünnung der Kulturen
Vorbesprechung Versuch 2 (Ziebart)
Versuch 1.2: Plasmidisolation
Einrichten der Arbeitsplätze
Versuch 1.2: Gelelektrophorese der isolierten Plasmide
14:00-15:00 Versuch 1.1: E. coli-Transformation Versuch 2: Einweisung in steriles Arbeiten
Versuch 2.2: Auswertung der Trypanosoma-Kulturen nach 24 h (Auszählen und Fluoreszenzmikroskopie)
15:00-16:00 Versuch 1.1: Ausplattieren der E. coliTransformanten Versuch 2.1: Auszählen der TrypanosomaZellen 16:00-17:00 Versuch 2.1: Verdünnung und Induktion der Trypanosoma-Zellen
Versuch 2.1: Induktion der TrypanosomaZellen Versuch 1.2: Ansetzen von Ü/N-Kulturen
1 Komplementation einer Auxotrophiemutante und Isolierung des mutierten Gens 2 Regulierte Genexpression und RNAi in Trypanosoma brucei Versuche: 3 Herstellung von Taq DNA-Polymerase 4 Übertragung eines transkriptionellen Regulationssystems aus Lotus japonicus in Hefe und Tabak
Versuch 2.2 und 2.3: Auswertung der Trypanosoma-Kulturen nach 48 h (Auszählen, Fluoreszenzmikroskopie und Durchflusszytometrie), Abschlussbesprechung
Versuch 1.2: Auswertung der Gelelektrophorese Versuch 3.1: Induktion der E. coliKulturen
Ablaufplan Vorlesung und Praktikum Genetik 2 Stand: 13.10.15 Woche 2 (07.-11.12.15) Montag
Dienstag
Mittwoch
Donnerstag
Freitag
Splicing (Parniske)
Chromatin Restructuring (Parniske)
Transcription Factors (Parniske)
9:00-10:00
10:00-11:00
Vorbesprechung Versuch 3 (Ott) 11:00-12:00 Vorbesprechung Versuch 1 (Brachmann)
Vorbesprechung Versuch 3 (Ott) Vorbesprechung Versuch 1 Restriktionsanalyse (Brachmann)
DNA-Sequenzierung und Sequenzanalyse (Brachmann)
12:00-13:00
13:00-14:00
Versuch 3.1: Zellaufschluß
Versuch 1.3: Ansetzen von Restriktionsreaktionen
Versuch 1.3: Gelelektrophorese der Restriktionsansätze
Versuch 3.2: Gelelektrophorese der TestPCR
Versuch 3.1: SDSPAGE der Proteinfraktionen
Versuch 1.3 und 1.4: Auswertung der Restriktionsansätze und der Sequenzierungsreaktionen; Bestimmung der potentiell mutierten Gene
14:00-15:00 Versuch 1.4: Ansetzen von Sequenzierungsreaktionen
Versuch 3.2: Test-PCR zur Bestimmung der Polymeraseaktivität
Versuch 4.1: Vereinzelungsausstriche der Hefetransformanten
15:00-16:00
Versuch 3.1: Aufreinigung von Taq DNAPolymerase und Dialyse
Versuch 1.3: Auswertung der Gelelektrophorese
Versuch 3.1 und 3.2: Auswertung der Gelelektrophoresen; Bestimmung der spezifischen Aktivität der Taq-Polymerase; Abschlussbesprechung
16:00-17:00 Versuch 3.1: Coomassiefärbung der SDSGele
Versuch 1.5: Amplifikation von Genen
1 Komplementation einer Auxotrophiemutante und Isolierung des mutierten Gens 2 Regulierte Genexpression und RNAi in Trypanosoma brucei Versuche: 3 Herstellung von Taq DNA-Polymerase 4 Übertragung eines transkriptionellen Regulationssystems aus Lotus japonicus in Hefe und Tabak
PCRE. coli-
Ablaufplan Vorlesung und Praktikum Genetik 2 Stand: 13.10.15 Woche 3 (14.-18.12.15) Montag
Dienstag
Mittwoch
Donnerstag
Praktikumsvorbesprechung (Katzer)
Praktikumsvorbesprechung (Katzer)
Versuch 4.1: OD600-Messung und Überimpfen der Hefekulturen
Versuch 4.2: Ansetzen der Färbung zur Bestimmung der β-Glucuronidaseaktivität
Tutorium zum Praktikum (Brachmann)
Tutorium zum Praktikum (Brachmann)
Freitag
9:00-10:00 Tutorium zur Vorlesung (Parniske)
Symbiose (Parniske)
10:00-11:00
11:00-12:00
Praktikumsvorbesprechung (Katzer)
12:00-13:00
Versuch 4.2: Ernte der Agrobakterienkulturen 13:00-14:00 Versuch 1.5: Aufreinigung der PCRProdukte
CRISPR/Cas und Gentechnologie (Parniske)
Versuch 1.5: Gelelektrophorese der PCRProdukte
Versuch 1.6: Auswertung der Sequenzierungsreaktionen, Abschlussbesprechung
Kursraum aufräumen
14:00-15:00
Versuch 4.2: Transformation von Tabakpflanzen
15:00-16:00 Versuch 1.5: Auswertung der Gelelektrophorese
Versuch 4.1: Bestimmung und Auswertung der βGalaktosidaseaktivität
Versuch 1.6: Ansetzen von Sequenzierungsreaktionen
Gemeinsame Abschlussbesprechung
16:00-17:00 Versuch 4.1: Ansetzen von Übernachtkulturen
Versuch 4.2: Bestimmung der βGlucuronidaseaktivität; Auswertung und Abschlussbesprechung
Zeit für Dokumentation, Auswertung, Fragen, etc.
1 Komplementation einer Auxotrophiemutante und Isolierung des mutierten Gens 2 Regulierte Genexpression und RNAi in Trypanosoma brucei Versuche: 3 Herstellung von Taq DNA-Polymerase 4 Übertragung eines transkriptionellen Regulationssystems aus Lotus japonicus in Hefe und Tabak
"CRISPR/Cas-assisted genome engineering: strategies and apllications" (Sebastian Bultmann, AG Leonhardt)
