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labolink Nr. 09/2015
Infektiöse Gastroenteritis-Erreger Nachweis mittels Multiplex PCR Einführung Diarrhoen haben verschiedenste Aetiologien – eine der wichtigsten ist infektiöser Genese, ausgelöst durch Bakterien, Viren und Parasiten. Aufgrund der Symptomatik lässt sich der Erreger häufig nicht eingrenzen. Mit der Multiplex PCR werden ein Grossteil der in Frage kommenden Erreger diagnostiziert.
Gastroenteritis-Erregern zu identifizieren. Als Material genügt eine einzige Stuhlprobe. Untersuchungsmaterial Stuhl in Fecal-Swab (Cary-Blair-Medium); bei positivem PCR-Resultat werden Salmonellen und Campylabacter gemäss Epidemiegesetz mittels Kultur weiter typisiert und EHEC vom Nationalen Zen trum für enteropathogene Bakterien und Listerien (NENT) bestätigt.
Diagnostik Mit der Multiplex PCR steht ein neuartiger molekularbiologischer Test zur Verfügung, der simultan nach den häufigsten Erregern von Magen-Darm-Infektionen in einer Stuhlprobe fahndet. Die parallele Testung ermöglicht auch den Nachweis von Koinfektionen. Mithilfe dieses molekularbiologischen Verfahrens ist es möglich, schon kleinste Mengen von bakteriellen, viralen und parasitären
Methode Genomnachweis mittels Multiplex-PCR Kosten 360 CHF
Tabelle: Das Erregerspektrum Erreger
Sensitivität a)
b)
Spezifität c)
a)
b)
c)
Bakterien Campylobacter (jejuni, coli, upsaliensis)
97.1 %
Clostridium difficile toxin A / B
98.8 %
Plesiomonas shigelloides
100 %
Salmonella
100 %
98.4 % 97.1 % 100 %
100 %
99.0 %
100 %
100 %
99.6 %
Vibrio (parahaemolyticus, vulnificus, cholerae)
–
100 %
97.4 %
99.9 %
100 %
100 %
Vibrio cholerae
–
100 %
84.6 %
99.9 %
100 %
100 %
100 %
100 %
Yersinia enterocolitica
100 %
Enteroaggregative E. coli (EAEC)
98.8 %
98.2 %
Enteropathogene E. coli (EPEC)
99.1 %
97.2 %
Enterotoxische E. coli (ETEC)
100 %
99.4 %
Enterohämorrhagische E. coli (EHEC)
100 %
99.7 %
E. coli O157
100 %
97.1 %
Shigella / Enteroinvasive E. coli (EIEC)
95.9 %
99.9 %
100 %
Parasiten Cryptosporidium
100 %
Cyclospora cayetanensis
100 %
Entamoeba histolytica Giardia lamblia
– 100 %
96.7 %
99.6 %
100 %
100 % 100 % 100 %
88.0 %
100 %
100 %
99.5 %
100 %
100 %
Viren Adenovirus F 40 / 41
95.5 %
Astrovirus
100 %
Norovirus GI / GII
94.5 %
Rotavirus A
100 %
Sapovirus (Genogrp, I, II, IV und V)
100 %
99.1 % 96.9 %
99.9 %
100 %
98.8 % 100 %
99.2 %
100 %
99.1 %
Daten aus: a) klinischer prospektiver Studie (Sarah N. Buss, et al. Multicenter Evaluation of the BioFire FilmArray Gastrointestinal. Panel for Etiologic Diagnosis of Infectious Gastroenteritis, JCM, March 2015 Volume 53 Number 3); b) archivierten Proben; c) standardisierte Proben
Autor: Dr. med. M. Brandenberger, FAMH, Laborleiter Mikrobiologie Redaktion: Prof. em. Dr. med. Raymond Auckenthaler, Chief Medical Officer Kompetenzzentrum Luzern · T 041 360 35 35 © synlab Suisse SA, September 2015